美国政府担心IBM PC部门售予联想可能危及国家安全，有关部门正着手调查此案，可能导致购并案生变。

报导指出，美国外资审查委员会（Committee on Foreign Investment）、司法部及国土安全部（Dept. of Homeland Security）等部门担心若联想购并IBM PC部门在美国的资产，可能利用位于北卡罗莱纳州的生产基地进行搜集产业机密活动，甚至将高科技信息及技术用于军事用途。

外资审查委员会由美国财政部以及其它11个政府部门的代表组成，购并案必须经过该委员会核准，否则就必须由政府主导正式调查，并在调查结束后确认无妨美国国家安全后，由总统签署命令确认通过购并案。

IBM发言人指出，已向外资审查委员会呈交其要求之所有文件，IBM将尽力与主管机关配合，力求通过此案；联想发言人也公开声明，该公司将全力配合美政府之需求，提供任何相关资料。IBM与联想在2004年12月29日对外外国投委员会提出报告，希望购并案得到批准；若外资审查委员会未在30天内批准，就必须展开正式调查。

美国外资审查委员会负责审查境外企业有意购并美国业者的案件，由于之前该委员会曾宣告Global Crossing的信息不得售予香港的和记黄埔（Hutchison Whampoa），更令联想案受瞩目。据曾在该委员会任职之美国官员指出，该委员会鲜少让购并案进行到正式调查的阶段。

但日前美政府曾对8家大陆业者进行程度不同的惩罚，因为上述业者将技术出口到伊朗，而被用于飞弹相关的软硬件中，此事更显示当高科技技术与国家安全沾上边后，会使单纯商业行为显得更加复杂；联想案会引起国家安全考虑的原因在于，持有其股权大部分的联想集团由中国科学院分出。